Joe Logan, yang tampak seperti pria biasa, menjalani kehidupan damai di pedesaan bersama istri dan anaknya. Namun, keluarga Logan sebenarnya telah menggunakan identitas palsu untuk melarikan diri dari masa lalu Joe sebagai pembunuh ninja yang menakutkan. Meskipun telah melakukan serangkaian pembunuhan terhadap mantan rekan-rekannya, Joe yakin bahwa kehidupan barunya aman—tetapi ketenangan dan kebahagiaannya segera hancur ketika keluarganya dibantai oleh anggota klan lamanya.
Ditinggalkan dalam keadaan sekarat, Joe terbangun di rumah sakit, tidak yakin bagaimana ia bisa selamat dari luka-luka yang seharusnya membunuhnya. Detektif polisi Emma Samanda dan Mike Moriss, yang ditugaskan untuk menyelidiki kematian keluarga Logan, menyaksikan upaya pembunuhan lain terhadap Joe. Namun, kali ini Joe sudah siap. Dengan menggunakan teknik rahasia, ia dengan mudah mengalahkan musuh-musuhnya, melepaskan identitas barunya dalam proses tersebut.
Merangkul cara lamanya, Joe menyelimuti dirinya dengan persona lamanya, menghancurkan organisasi yang pernah ia layani atas nama balas dendam berdarah dingin. Dibantu oleh duo detektif dalam perburuannya, Joe tidak akan berhenti sampai ia berhasil mengalahkan masa lalunya dan iblis-iblis yang berasal darinya.