Mencari tujuan hidup, Hisone Amakasu bergabung dengan Angkatan Udara Bela Diri Jepang (JASDF) dan ditempatkan di Pangkalan Udara Gifu. Selama kunjungan ke bagian pangkalan yang tidak ia ketahui keberadaannya, ia menemukan rahasia terbesar JASDF: Penerbang Transformasi Organik (OTF), seekor naga yang memiliki kemampuan untuk menyamarkan diri sebagai pesawat terbang. Setelah ditelan dan dimuntahkan oleh OTF, para komandannya memberitahunya bahwa pertemuan ini berarti ia telah dipilih untuk menjadi penerus dalam garis keturunan panjang Pilot Naga.
Bersama dengan rekan-rekan kadet pilotnya dan "Maso-tan," OTF-nya sendiri, Hisone harus mengatasi rasa tidak amannya untuk menemukan potensi sebenarnya sebagai Pilot Naga dan mengungkap rahasia di balik OTF.