Di dalam kota berkubah Romdo terdapat salah satu peradaban manusia terakhir di Bumi. Ribuan tahun yang lalu, bencana ekologis global menghancurkan planet ini; sekarang, kehidupan di luar kubah-kubah ini hampir mustahil. Untuk mempercepat pemulihan umat manusia, "AutoReivs," robot mirip manusia, telah diciptakan untuk membantu manusia dalam kehidupan sehari-hari mereka. Namun, AutoReivs mulai tertular penyakit misterius yang disebut "Virus Cogito," yang memberi mereka kesadaran diri. Re-l Mayer, cucu penguasa Romdo, ditugaskan untuk menyelidiki fenomena ini bersama dengan rekannya sesama AutoReiv, Iggy. Tetapi apa yang dimulai sebagai penyelidikan rutin dengan cepat berubah menjadi konspirasi ketika Re-l dihadapkan pada dosa-dosa tergelap umat manusia.
Di tempat lain di Romdo, seorang spesialis AutoReiv bernama Vincent Law juga harus menghadapi iblis-iblisnya ketika peristiwa-peristiwa surealis mulai terjadi di sekitarnya. Re-l, Iggy, Vincent, dan anak AutoReiv bernama Pino akan membentuk kelompok yang tak terduga saat mereka berjuang untuk mengungkap misteri Romdo dan menemukan tujuan sebenarnya dari makhluk mitos yang disebut "Proxy."