Sakura Kinomoto, seorang siswi kelas empat berusia sepuluh tahun yang tinggal di Tomoeda, menemukan sebuah buku kartu misterius berjudul "The Clow" (Kartu Clow). Saat merenungkan penemuannya, ia tanpa sengaja menyebabkan hembusan angin magis yang menyebarkan kartu-kartu tersebut ke seluruh kota.
Kecelakaan itu membangunkan Sang Binatang Segel—Keroberos, yang dijuluki "Kero"—yang memberi tahu Sakura bahwa ia telah melepaskan "Kartu Clow" mistis yang diciptakan oleh penyihir Clow Reed. Karena kemampuan setiap Kartu untuk bertindak secara independen dan kekuatan luar biasa mereka, Clow telah menyegelnya. Sekarang setelah dibebaskan, Kartu-kartu tersebut menimbulkan bahaya besar bagi dunia, dan Sakura harus mengakhiri keberadaan mereka.
Menunjuk Sakura sebagai "Penangkap Kartu" dan memberinya Kunci Segel, Kero menugaskannya untuk menemukan dan menangkap kembali semua Kartu Clow. Bersama sahabat karibnya, Tomoyo Daidouji, dan dengan bimbingan Kero, Sakura harus belajar menyeimbangkan tugas rahasianya yang baru dengan masalah sehari-hari saat ia memulai petualangan magisnya sebagai Cardcaptor Sakura.